Tersedia 1026 judul buku pada Perpustakaan Digital MTsN 3 Mojokerto yang dapat digunakan sebagai sumber literasi utama dalam proses Pembelajaran. yang terdiri dari beberapa kategori sebagai berikut :

1. 1. Umum
2. 2. Filsafat dan Psikologi
3. 3. Agama
4. 4. Sosial
5. 5. Bahasa
6. 6. Sains dan Matematika
7. 7. Teknologi
8. 8. Seni dan Rekreasi
9. 9. Literatur dan Sastra
10. 10. Sejarah dan Geografi
11. 11. Kategori 2X
12. 12. Kategori 9X3